太魯閣國家公園管理處指出，根據學者專家在太魯閣國家公園區內調查和統計，海拔一千公尺以下是濕潤高溫亞熱帶闊葉林，因為人類大幅度的開發與干擾，棲息的鳥類包括有竹雞、小彎嘴畫眉、紅嘴黑鵯、台灣藍鵲及五色鳥等都具有很強的適應力。

    太魯閣國家公園管理處表示，海拔一千公尺至兩千三百公尺之間，屬於是濕度更高的溫帶針闊葉混合林，由於雨量多，草木龐雜繁盛，算是台灣森林鳥類最多的地方，林間灌叢常有山紅頭、頭鳥線、棕噪眉與黃胸藪眉跳耀其中；樹枝上則很容易看見繡眼畫眉、小啄木、冠羽畫眉，青背山雀、黃腹琉璃及白目畫眉等鳥類的蹤影。

    在新白楊一帶可以觀察到了毛腳燕、山紅頭、巨嘴鴉、茶腹尸、灰喉山椒、松鴉、青背山雀、紅胸啄花、冠羽畫眉、黃腹琉璃、白耳畫眉、大冠鷲及林鵰共十三種，在林間上空則常見大冠鷲、鳳頭蒼鷹及小雨燕等在空中盤旋和覓食。

    太管處說，海拔兩千三百公尺至三千三百公尺為寒帶針葉林，因為海拔高度高、溫度低冷、強風吹拂的關係，樹木的種類和數量較少，因此棲息其間的鳥類也隨之減少，黑長尾雉、深山鶯等分布在樹林底層灌叢中，但不易見其蹤影，樹林上層則有紅頭山雀、煤山雀、火冠戴菊（台灣特有種)及金翼白眉（台灣噪眉)等鳥種混居跳躍期間。

    海拔三千三百公尺以上的高山地區，因冬季氣候嚴寒，植被大多只有高山芒和高山箭竹草原，食物資源相當有限，棲息的鳥類也很少，常見到岩鷚停棲在空曠地區，或裸露的岩石上。
太管處多年曾舉辦「合歡越嶺步道尋山鳥活動」，活動中總共觀察到二十種高海拔山鳥與中海拔霧林帶鳥類，分別在海拔三千公尺的合歡山區觀察到了金翼白眉、灰鷽、酒紅朱雀、深山鶯、栗背林鴝、岩鷚、紋翼畫眉及鵟等鳥類。
值得一提的是，近年來，在中橫公路旁觀雲山莊一帶山區，發現臺灣國鳥帝雉（Syrmaticus mikado 又名黑長尾雉)的蹤跡，由於帝雉屬於台灣特別種，讓保育人員相當振奮。帝雉在仟元鈔上可以看見，一般民眾對帝雉與藍腹鷴傻傻分不清，還怎麼分辨帝雉及藍腹鷴？看腳就知道了，紅色的腳為藍腹鷴，黑色的腳為帝雉；頭上有一搓白白的毛是藍腹鷴，帝雉則沒有。

    此外，在合歡東峰觀察到稀有過境猛禽「鵟」（為該二零一一年八月許育誠老師初次紀錄後，再度觀察記錄到），文獻中提到這種猛禽來自歐亞大陸，在台灣偶有紀錄渡冬個體，當天觀察到的個體，也有可能是在合歡山區渡冬，以高山田鼠等囓齒類動物做為捕食對象的遊子。

    太管處強調，入冬後，除了高山地區的鳥類為了避冬，紛紛往較溫暖遷的山下移外，同時這個時節也有許多冬候鳥進入台灣，在國家公園區內可以觀察到多種的冬候鳥，在該園區內，最理想的觀察鳥類的地區為布洛灣台地，可以看見高山往下遷移的鳥類及冬候鳥，每年都吸引大批鳥友在布洛灣台地聚集賞鳥。