根據聯合報報導指出，林欣榮表示，台灣西部也許不缺藥師，但花東藥師需求大，花蓮慈濟醫院至今仍有十五位藥師缺額，西部地區培養的醫事人員，即使赴東部服務，也難長留久任。副院長陳星助也補充，過去藥界認為藥師人數充足，總有人去東部，但花東十多年來就是沒人。

林欣榮於該篇報導中指出，自己二十多年前到慈院服務時，還要親自拜託資深藥師才能留人；花蓮慈濟人資部門曾統計醫師出身學校，至少約有七成是慈濟大學畢業。若能在地培養藥師，藥學生對花蓮醫療環境、病患樣態有了解、有感情，也更有機會留任。

陳星助說，新設藥學系是培養六年制的臨床藥師，與基層藥局藥師工作內容不同，主要負責醫院臨床工作，包括癌症病人化療藥物調藥等，且每年只收三十位學生

中華民國藥師公會全國聯合會九月底針對慈濟大學增設藥學系事件，表達嚴正抗議，並發布新聞稿：「本會屬藥界最具代表性團體之一，然教育部與衛福部卻於未徵詢本會意見之下作成決定，顯非合理。另本會亦於第一時間表達，藥學教育制度與藥師執業品質、藥師人力市場，以及國民用藥健康有重大關係，不應貿然增額，相關主管機關應盤點目前藥師人力市場情況，分析其中問題，並深入了解各藥學系員額、課程、師資等情況，訂定制度推動藥學教育全面改革，精進教學品質。」

而衛福部也之後出面解釋，設立考量的是醫事人力嚴重分布不均。是因為東部藥師人力明顯低於全國平均，希望能在地培養人才，彌平城鄉醫療差距。

部分藥師也相挺，認為只開三十個名額，佔總缺額不到百分之一，設立地點還是在人才招募困難的花東地區。實在沒必要特地抗議。

事實上，花東不只藥師，包括醫師、護理師都較西部難以招募，因醫療資源與民眾健康息息相關，衛生福利部也曾在「優化偏鄉醫療精進計畫」中指出，偏遠及離島地區因為人口較少，就醫人次未達一定數量，執業所得不符經濟效益；加上地理環境特殊、交通不便，且須考量家庭生活及子女教育等因素，導致人員招募及留任的困難，也難以長駐。